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國家植物園由國家批準(zhǔn)設(shè)立，與普通的植物園不同。其核心功能包括植物科學(xué)研究和遷地保護(hù)，它的社會服務(wù)功能建立在學(xué)術(shù)研究功能基礎(chǔ)上。國家植物園的定位是國家植物科學(xué)研究和交流中心、戰(zhàn)略植物資源儲備庫、瀕危植物的遷地保護(hù)基地以及植物科學(xué)傳播中心。

國家植物園是一個國家經(jīng)濟(jì)、科技、文化、生態(tài)、社會可持續(xù)發(fā)展水平的重要標(biāo)志；國家植物園是中國植物多樣性保護(hù)、研究的主要基地和世界珍稀瀕危植物的保護(hù)設(shè)施，代表著我國植物多樣性保護(hù)、研究和利用的最高水平；國家植物園是國家生態(tài)文明建設(shè)成果的展示平臺，在國際交往中發(fā)揮著重要職能。這些重要功能也是國家植物園與其他植物園的主要區(qū)別。

豐富的植物物種收集和珍稀瀕危植物的遷地保護(hù)是國家植物園的根本特色，無論是植物資源的遷地保護(hù)、科學(xué)研究還是科學(xué)傳播和園林園藝展示，都建立在豐富的物種收集基礎(chǔ)上。國家植物園在整個國家植物園體系建設(shè)中具有十分重要的引領(lǐng)作用，是國家植物園體系的核心。國家植物園體系建設(shè)是從國家層面進(jìn)行生物多樣性保護(hù)的一項重要措施，將有效實現(xiàn)中國植物多樣性保護(hù)全覆蓋和可持續(xù)利用：一是構(gòu)建國家植物遷地保護(hù)網(wǎng)絡(luò)。除了建設(shè)國家植物園以外，還要建設(shè)一批區(qū)域性國家植物園，目前華南國家植物園也已正式掛牌運行，未來國家植物園和各區(qū)域的國家植物園既有分工又有合作，實現(xiàn)資源共享，有效實現(xiàn)中國植物多樣性保護(hù)全覆蓋和可持續(xù)利用，全面提升國家植物多樣性保護(hù)和研究水平。二是提升遷地保護(hù)穩(wěn)定性和可靠性。國家植物園體系的建設(shè)將實現(xiàn)植物在多地進(jìn)行遷地保護(hù)，有利于降低因區(qū)域自然災(zāi)害、極端天氣及突發(fā)狀況造成的植物物種滅絕風(fēng)險，為國家保存重要的戰(zhàn)略植物資源。三是引領(lǐng)示范全國植物園科學(xué)、均衡發(fā)展。國家植物園體系的建設(shè)將帶動我國各地植物園全面提升建設(shè)、管理和發(fā)展水平。四是向世界傳播中國植物文化。收集展示具有民族特色的資源植物，為人民群眾提供優(yōu)質(zhì)的生態(tài)產(chǎn)品和美好的精神享受，向世界展現(xiàn)中國悠久歷史文化和民族精神。